1940-talet började i skuggan av kriget, men trots bränslebrist, ransonering och militära avspärrningar höll Årstavikens Segelsällskap ihop och fortsatte sin verksamhet med oförminskad tro på framtiden. Sommarprogrammen bantades, men seglingarna på Årstaviken levde vidare, och i hamnen hölls arbetet igång med målning, reparationer och ny eldragning till slipspelet. Feststämningen fanns kvar – höstfester, små danser i båthus och kamratskap på hemmavattnen höll gemenskapen levande.
När huvudstaden spärrades av och vedflottningen tog över Årstaviken visade medlemmarna på enastående uppfinningsrikedom: motorbåtar försågs med gengas, karbidaggregat och till och med pedaler för att kunna ta sig ut på sjön. Trots svåra tider samarbetade klubbarna och ordnade tävlingar där det gick, och ÅSS seglare fortsatte att göra fina resultat.
Under krigets slutskede 1944 drabbades klubben av en dramatisk händelse när bomber föll över Stockholm – splitter skadade kanotskjulet vid Eriksdals friluftsteater. Lyckligtvis undkom ingen allvarligt, och verksamheten kunde snart återgå till det normala.
När freden kom 1945 återvände framtidstron snabbt. Nya betongpontoner anlände, bryggorna rustades upp och ett nytt vandringspris, Årstaskölden, instiftades. De följande åren fylldes hamnen åter med båtar, nattvakter anställdes och stora motorbåtsbryggan förlängdes. Klubbens sociala liv tog ny fart med återkommande kräftfester, eskaderfärder till Verkan och återstartade tävlingar.
Kronan på verket blev 50-årsjubileet 1948, firat med rekorddeltagande och glädje både på land och till sjöss. Sällskapet hyllades med en fana från Svenska Flaggans Dag och nya vandringspris tillkom. Jubileumsfesten på Verkan samlade hundratals medlemmar och symboliserade ett efterlängtat återseende mellan generationer.
Efter decenniets slut fortsatte ÅSS att växa och moderniseras, med nybyggnationer i hamnen, bättre belysning, och en växande klubbanda. 1940-talet blev ett årtionde av uthållighet, vänskap och nystart – ett bevis på att viljan och gemenskapen bar Årstavikens Segelsällskap även genom de svåraste tiderna.
